מומים מולדים אינם תוצאה של סוכרת הריונית. הם יכולים להיות סיבוך של סוכרת טרום הריונית. זאת כיון שבסוכרת טרום הריון לא מאוזנת במהלך ההפריה יש השפעה של רמות גלוקוז גבוהות על חלוקה תקינה של העובר. מצב כזה לא מתרחש בסוכרת הריון. כיון שסוכרת הריון מתגלה לראשונה בהריון (כלומר לאחר שהעובר נוצר)