כדי שאנזימי הליזוזום (הנקראים הידרולאזות חומציות - Acid Hydrolases) יהיו פעילים, צריכים לקרות שני דברים עיקריים:
1. הורדת הפוספט: האנזימים הללו נשלחים מהגולג'י אל הליזוזום כשהם מסומנים בסוכר שנקרא מנוז-6-פוספט (M6P). הסימון הזה משמש כ"כתובת למשלוח". ברגע שהאנזים מגיע לליזוזום, ההורדה של קבוצת הפוספט היא חלק מתהליך ההבשלה שלו והפיכתו לאנזים פעיל.
2. pH חומצי: האנזימים האלו תוכננו לעבוד רק בסביבה חומצית מאוד (pH סביב 5.0). הליזוזום שומר על חומציות זו באמצעות משאבות פרוטונים (H+) המכניסות יוני מימן לתוכו.