ה CDK של שלב ה S הופך להיות פעיל מיד לאחר שהוא נקשר לציקלין ללא צורך בפעולה נוספת 

קישור הציקלין ל-CDK הוא תנאי הכרחי אך לא מספיק להפעלה מיידית. כדי שהקומפלקס יהפוך לפעיל, נדרשות פעולות נוספות: 1. פוספורילציה (זרחון): ה-CDK חייב לעבור זרחון באתרים מסוימים (על ידי אנזים הנקרא CAK) כדי להפוך לפעיל מבנית. 2. דה-פוספורילציה: במקרים מסוימים (כפי שהוסבר על M-CDK ורלוונטי למנגנוני בקרה דומים), יש להסיר זרחונים מעכבים. 3. הסרת מעכבים: קומפלקס S-CDK מעוכב לעיתים קרובות על ידי חלבונים מעכבים (כמו {p21} או {p27}, כפי