בעזרת CHIP ניתן לגלות אינטראקציות חלבון-DNA

לא סתם היה כתוב CHIP ולא CHIPseq. ב-CHIP מוצאים אינטרקציה בין חלבון לדנ"א. ב-CHIPseq שזה שיטת הרחבה ל-CHIP מרצפים את הרצף דנא שמצאנו מהאינטרקציה בין החלבון לדנ"א.