BCA (Bicinchoninic Acid Assay): זוהי שיטה קולורימטרית נפוצה ויעילה לכימות חלבונים כולל בדוגמאות מרובות חלבונים. היא מבוססת על תגובה של יוני נחושת (Cu$^{2+})עםקשריפפטידבחלבונים(תגובהביוּרֵט),ולאחרמכןתגובהשליוניהנחושתהמחוזרים(Cu^{+}$) עם חומצה ביקונינכונינית (BCA), אשר יוצרת תוצר סגול הניתן לכימות ספקטרופוטומטרית. היתרון הגדול של שיטה זו הוא שהיא אינה דורשת ידע ספציפי על רצף החלבונים בדוגמה.
כימות לפי חומצות אמינו: שיטה זו אכן יכולה לספק מידע כמותי מדויק על חלבונים, אך היא דורשת הידרוליזה של החלבונים לחומצות אמינו ולאחר מכן הפרדה וכימות של חומצות האמינו. למרות שהיא אינה דורשת ריצוף "ישיר" של החלבונים, היא עדיין תהליך מורכב יותר ופחות "כללי" לכימות כולל של חלבונים בדוגמה מרובת חלבונים מבלי לדעת מראש אילו חלבונים קיימים.
אלייזה בשיטת סנדוויץ' (Sandwich ELISA): שיטה זו היא ספציפית ביותר ומיועדת לזיהוי וכימות של חלבון יחיד וספציפי בתוך תערובת מורכבת. היא דורשת נוגדנים ספציפיים לחלבון המטרה ולכן אינה מתאימה לכימות כללי של "דוגמה מרובת חלבונים" ללא צורך בריצוף, אלא אם כן רוצים לכמת חלבון מסוים מאוד מתוך התערובת. היא דורשת ידע מוקדם על החלבון שאותו רוצים לכמת וזמינות של נוגדנים מתאימים.