מבנה פולימרי מורכב והוא מעניק לדופן את קשיחותה. בבניית הפפטידוגליקן משתתפים בסך הכל שני סוכרים וחומצות אמיניות, בדרך כלל 3-4. הסוכר האחד הוא נגזרת של הגלוקוז, שבו לפחמן 2 קשורה קבוצה אמינית שאחד ממימניה מוחלף בקבוצת אצטיל.