טה
- 113 שאלות
- 24 תגובות
- 0% הושלמו
- equalizer סטטיסטיקות
- share שתף
Discuss, Learn and be Happy דיון בשאלות
help
brightness_4
brightness_7
format_textdirection_r_to_l
format_textdirection_l_to_r
זן העגבניה "יוסי" עמיג לבוטריטיס והזן "יונה" רגיש. מטרתך להעביר באמצעות BC את העמידות מ"יוסי" ל"יונה". העמידות הינה בגן יחיד רצסיבי. זן "יונה" הינו הומוזיגוט בגן המקנה רגישות( כלומר הומוזיגוט דומננטי בגן זה). בשלב BC1 איזה שיעור של הצמחים יגלה עמידות לבבוטריטיס.
1
מיין לפי
מוניטין: 30
כדי להעביר עמידות מהזן "יוסי" ל"יונה" באמצעות ה-Backcrossing (BC), ובהתחשב בכך שההתנגדות לבוטריטיס ב"יוסי" ניתנת על ידי גן בודד רצסיבי, עלינו לשקול את המבנה הגנטי של שני הזנים.
- "יוסי" עמיד בפני בוטריטיס, כלומר הוא נושא את האלל הרצסיבי העמיד במצב הומוזיגוטי (בואו נסמן את אלל העמידות כ-r ואת המצב הרצסיבי שלו כ- (rr)
- "יונה" רגיש לבוטריטיס, כלומר הוא נושא את האלל הדומיננטי לרגישות במצב הומוזיגוטי (מסומן S עבור רגישות ומצבו ההומוזיגוטי כ- SS
דור F1 : ההכלאה הראשונה בין "יוסי" rr"ויונה" SS תוליד צאצאים הטרוזיגוטיים Sr כאשר S הוא האלל הדומיננטי לרגישות, ו-r הוא האלל הרצסיבי לעמידות. מכיוון שהאלל העמידות r הוא רצסיבי, כל צמחי ה-F1 Sr יהיו רגישים לבוטריטיס מכיוון שהנוכחות של אלל S בודד מספיק כדי להעניק רגישות.
דור BC1 : הצלבה לאחור כוללת חציית דור F1 אחורה עם אחד מקווי ההורים. במקרה זה, כדי להעביר עמידות מ"יוסי" ל"יונה", דור ה-F1 Sr נחצה בחזרה עם "יונה" SS
בהינתן שהתכונה לעמידות היא רצסיבית, צאצא BC1 יהיה תערובת של גנוטיפים SS ו-Sr , מכיוון ש"יונה" יכול לתרום רק אלל S.
Sr (מ-F1) * SS (מתוך "יונה") היה מייצר:
50% SS (רגיש)
50% Sr (רגיש, כי העמידות היא רצסיבית ואינה מתבטאת בנוכחות S)
סיכום:
אף צמחי BC1 לא יראו עמידות לבוטריטיס מאחר והעמידות היא רצסיבית ומתבטאת רק ב- גנוטיפ rr , שלא ניתן לייצר ב BC -זו עם הורה SS התורם רק אללים רגישים דומיננטיים.
אז, שיעור הצמחים המציגים עמידות לבוטריטיס בשלב BC1 יהיה 0%.
איזה מהבאים הכי נכון?
1
| done | ||
הטרוזיס כל אחד משני האללים של גן שמקנה הטרוזיס תורם לתכונה
או בגדול הטרוזיס זה זן שקיבל תכונה גם מהאמא וגם מהאבא ויצא תוצאה חדשה שלא הייתה לפני כמו עגבניה אדומה ומפוספסת
מיין לפי
הינך מטפח עגבניות לתעשיה ומטרתך לשפר את המוצקות. מהספרות עולה כי שישה גנים אחראים על תכונה זו. יצרת מיכלוא F1 בין שני קווי הורים עם מוצקות בינוני. כמה צמחים תישאף לגדל בדור F2
1
| done | ||
לקוח מהמצגת "שעור 9 - בעקבות הסיור"
מספר הפרטים שיש לדגום בF2 נגזר ממספר הגנים בהם נבדלים ההורים לגבי התכונות שעבורן תעשה סלקציה:
עבור השבחה חישוב מספר הפרטים לפי מספר הלוקוסים הנבדלים יהיה לפי הנוסחא 4 בחזקת n. (כאשר n מספר הלוקוסים לתכונה)
לכן 4 בחזקת 6 שווה 4096 שזה שווה בערך 4100
מיין לפי
עמידות לפוזריום בעגבניה הינה כתוצאה ממוטציה רצסיבית בגן ZAR . המוטציה הינה חסר של 100 בסיסים במסגרת הקראיה הפתוחה של ZAR . אורך תוצר PCR של האלל העמיד 500 BP ושל הרגיש 600 BP . לזן "אדם" רגישות הומוזיגוטית לפוזריום והזן "חווה" עמיד. הכלאתם בין הקוים. בדור F2 ערכתם אנליזיה PCR לגן לפורזיום.לאיזה תוצאה תצפו?
1
| done | ||
אם מתייחסים לזה כך:
AA - רגיש - 600BP
aa - עמיד - 500BP
הכלאה ראשונה (F1) - AAxaa נקבל 100% Aa
הכלאה שניה (F2) - AaxAa נקבל 25% של AA, עוד 25% של aa, ועוד 50% של Aa.
מיין לפי
מטפח ביצע הכלאה בין שני זני אגס ויצר אוכלוסיה של צאצאים. האללים של שני ההורים ידועים והם דומים באורכם. ידוע לו כי אחד מהאללים מכיל מוטציה לפוריות עצמית והוא מעונין לאפיין ולשמור רק צאצאים המכילים אלל זה. מהי הדרך הנכונה הפשוטה והמהירה ביותר לבצע זאת? ***לבדוק
1
| done | ||
ג - נכון - כדי לזהות במהירות ובדייקנות את הצאצאים המכילים את אלל המוטציה לפוריות עצמית, על המגדל לבצע השוואת רצף של ארבעת האללים ההוריים באמצעות CLOSTAL, עיצוב פריימרים לאלל מוטנטי מאזורים שמורים, PCR והפעלת ג'ל. השוואת רצפים באמצעות CLOSTAL תעזור למגדל לזהות קטעים של הגנום שנשמרים בין אללים הוריים לאלל מוטנטי. משם, ניתן לעצב פריימרים למקד לאתר המוטציה הספציפי, לנטר באמצעות PCR ולאמת באמצעות ריצת ג'ל. ביצוע CAPS (Cleaved Amplified Polymorphic Sequence) אינו הכרחי למשימה זו ורק יוסיף שלב נוסף.
מה אתם חושבים?
BLANST לא הכרחי פה..?
מיין לפי
מוניטין: 70
נראה לי שזה באמצעות CAPS, באמצעות שיטה זו אפשר לזהות מוטציות - מתבססת על SNP ואנזמי חיתוך. מרצים בג'ל את הרצפים להשוואה ואיפה שמקבלים שני בנדים - שם היה חיתוך - שם הייתה מוטציה.
לגבי תכנון פריימרים - נראה לי שצריך מאזורים שמורים, כי מצד אחד אתה רוצה את למצוא את האלל הספציפי, אבל מצד שני האללים דומים ויודעים באורכם אבל לא ידועה בדיוק המוטציה, לכן לא חושבה שאפשר לתכנן פריימר ספציפי לאלל מוטנט.
מוניטין: 16
אזורים עם הרבה כוכביות הם כנראה אזורים שמורים שניתן להכין מהם פריימרים אוניברסליים שישמשו לריצוף הגן ולעומת זאת אזורים עם מעט כוכביות הם אזורים לא שמורים שמהם ניתן לתכנן פריימר שהוא ספציפי לגן שלי (שכנראה כבר ריצפתי אותו) וכך להיות מסוגל להבדיל בין הגן שלי לגנים אחרים בעזרת PCR
זה ציטוט מתוך הסיכום של ביואינפורמטיקה בדרייב
ואני ירצה לדעתי דווקא למצוא את השונה בינהם....
מוניטין: 70
נשתמש בפריימרים אוניברסאליים כאשר לא יודעים בדיוק מה הרצף האמיתי ורוצים לוודא שנקבל תוצר בPCR .
נשתמש בפיירמרים ספציפיים (ספציפיים לאלל מסוים, לא לגן), נרצה לעשות את זה למשל כאשר עושים הכלאה בין שני זנים ויודעים מה האללים והרצפים שלהם ורוצים לבדוק איזה מהצאצאים מכיל את האלל S1, רוצים תשובה של כן ולא, עם פריימרים אוניברסליים מקבלים ריצוף של כולם (הרבה עבודה מיותרת), עם פריימרים ספציפיים רק מי שיהיה לו את האלל יתקבל תוצר בPCR ונוכל לקבל תשובה של כן ולא.
ציטוט מהקלטה של אמיר, עמי צודק
בקיצור לדעתי התשובה הנכונה: CLOSTA,תכנון פרימרים ספציפיים, PCR,הרצה בג'ל.
מתי הכי נכון להשתמש במבחן CAPS?
1
מיין לפי