Discuss, Learn and be Happy דיון בשאלות

help brightness_4 brightness_7 format_textdirection_r_to_l format_textdirection_l_to_r

מטריצות PAM מבוססות על תצפיות אמפיריות של רצפי חלבונים רחוקים.

1
done
by
מיין לפי

במטריצות ציונים PAM ו,BLOSUM- ככל שהציון של התאמה מסוימת הוא גבוה יותר כך הסיכוי שההתאמה התקבלה באופן מקרי הוא קטן יותר.

1
mood
by
מיין לפי

שני חלבונים אשר אחוז הזהות של חומצות האמינו שלהם נמוך יותר מאחוז הזהות באיזור הדמדומים (Zone Twilight) לא יכולים להיות הומולוגים.

1
done
by
מיין לפי

מטריצת PAM30 עדיפה על מטריצת PAM250 לצורך השוואה של חלבונים קרובים-רחוקים

1
done
by
מיין לפי

לפי אלטשול ,(1990) הרעיון המרכזי באלגוריתם BLAST הוא להפנות את תשומת הלב לזוגות מקטעים שמכילים צמדי מילים באורך W עם ציון של לפחות T

1
done
by
מיין לפי

המפתח למהירות של אלגוריתם BLAST הוא שאלגוריתם זה לא סורק את כל מרחב החיפוש בין שני הרצפים. זאת ועוד, המהירות הגבוהה של אלגוריתם BLAST מסייעת גם לרגישות בזיהוי של רצפים הומולוגים.

1
done
by
מיין לפי

המפתח למהירות של אלגוריתם BLAST היא צמצום של מרחב החיפוש של הרצפים אך במחיר של הפחתת הרגישות.

1
mood
by
מיין לפי

המפתח למהירות של אלגוריתם BLAST היא הרחבה של מרחב החיפוש של הרצפים אך במחיר של הגברת הרגישות.

1
done
by
מיין לפי

בעת ביצוע של חיפוש בשרת BLAST NCBI ניתן לבחור את גודל המילה ,(W) רמת הסף (T) ומטריצת הציונים בה יעשה שימוש (למשל, BLOSUM62 או PAM250)

1
sentiment_very_satisfied
by
מיין לפי

באלגוריתם ,BLAST שימוש במילים קצרות יותר צפוי להגדיל את הרגישות ולהפחית את מהירות החיפוש.

1
done
by
מיין לפי