Discuss, Learn and be Happy דיון בשאלות

help brightness_4 brightness_7 format_textdirection_r_to_l format_textdirection_l_to_r

במחקר חלבונים, מדען משתמש גם ב-size exclusion chromatography (SEC) וגם ב-tandem mass spectrometry (MS/MS). איזו מהאפשרויות הבאות מתארת בצורה המדויקת ביותר את תפקידי השיטות וכיצד הן משלימות זו את זו?

1
done
by
מיין לפי

מה תפקיד ה-His-tag בחלבון GFP בניסוי שעשינו?

1
done
by
מיין לפי
by Roy Agam
Roy Agam 0 נקודות · יותר מ-6 חודשים
מוניטין: 1
His-tag (תג היסטידין) הוא רצף קצר של חומצות האמינו היסטידין (בדרך כלל 6 – נקרא גם 6xHis), שמצורף לקצה של חלבון (למשל GFP) כדי לאפשר ניקוי (purification) פשוט ויעיל של החלבון. היסטידין נקשר בצורה חזקה ליוני ניקל (Ni²⁺) שנמצאים על גבי מצע כרומטוגרפי (למשל Ni-NTA resin). כך אפשר לבודד רק את החלבון המתויג מתוך תערובת של חלבונים בתא. ❌ למה שאר התשובות לא נכונות: מאפשר לחלבון להאיר באור פלואורסנטי – זו תכונה פנימית של GFP, לא של ה-His-tag מונע פירוק חלבון בליזוזום – אין קשר בין His-tag והגנה מפירוק משמש כאתר קישור לנוגדנים בפעולה של ELISA – His-tag לא משמש ל-ELISA, אלא לכרומטוגרפיה
by

מהי מטרת שיטת ברדפורד במעבדה 1?

1
done
by
מיין לפי
by Roy Agam
Roy Agam 0 נקודות · יותר מ-6 חודשים
מוניטין: 1
שיטת ברדפורד (Bradford assay) היא שיטת כימות צבעונית שנועדה למדוד את ריכוז החלבון בדגימה ביולוגית. מבוססת על שינוי צבע של הצבע Coomassie Brilliant Blue כאשר הוא נקשר לחלבונים. שינוי הספיגה באורך גל 595 ננומטר מאפשר לחשב את כמות החלבון באמצעות עקומת כיול. יתר השאלות: ❌ לזהות חלבונים ספציפיים ע"י נוגדנים – מתאים ל־Western blot / ELISA. ❌ לבדוק ניקיון חלבון – מתאים יותר ל־SDS-PAGE או כרומטוגרפיה. ❌ להפריד בין חלבונים בעלי משקל שונה – זו מטרת SDS-PAGE או Size-Exclusion Chromatography. לכן מטרת שיטת Bradford במעבדה היא כימות של חלבון — לא זיהוי ולא הפרדה.
by

מה ההבדל המרכזי בין צביעת Coomassie לבין Western blot בניסוי שביצענו?

1
done
by
מיין לפי

מהו CD86 ומה משמעות ביטויו על תאי מונוציט?

1
done
by
מיין לפי

כיצד נמדדה הפרשת הציטוקין TNF-alpha בניסוי?

1
done
by
מיין לפי
by Roy Agam
Roy Agam 0 נקודות · יותר מ-6 חודשים
מוניטין: 1
הסבר: TNF-alpha הוא ציטוקין מסיס שמופרש מתאים (למשל מונוציטים). כדי למדוד את כמותו, משתמשים לרוב ב־ELISA או בשיטות דומות לכך שמבוססות על קיטים מסחריים שנועדו למדוד רמות של חלבונים מסיסים בנוזל (כמו סופרןנט). השיטות הלא נכונות: ❌ צביעת קומסי – משמשת לצביעת חלבונים בג'ל, אבל לא מספקת כימות ספציפי של TNF-alpha. ❌ Western blot – יכולה למדוד TNF-alpha, אבל בתוך התא ולא בהכרח את ההפרשה לסופרןנט. ❌ pH – לא רלוונטי למדידת רמות TNF-alpha. אם אתה רואה בתרגול שאלה כזו, תמיד חפש תשובה שמתארת כימות של חלבון מסיס בסופרןנט, וזה הכי מתאים ל־ELISA או קיט כימות מסחרי.
by

למה שימשה קבוצת הביקורת ללא טיפול ב-LPS?

1
done
by
מיין לפי

איזו מהשיטות הבאות נועדה לזהות חלבון ספציפי מתוך תערובת מורכבת של חלבונים?

1
done
by
מיין לפי
by Roy Agam
Roy Agam 0 נקודות · יותר מ-6 חודשים
מוניטין: 1
Western blot – מבוססת על הפרדת חלבונים בג’ל (SDS-PAGE), העברתם לממברנה, ולאחר מכן זיהוי ספציפי באמצעות נוגדן ראשוני כנגד החלבון המבוקש. ➤ מאפשרת זיהוי איכותי וכמותי של חלבון מסוים מתוך תערובת מורכבת. שאר האפשרויות: Bradford – שיטה כללית לכימות סך החלבון, אינה מזהה חלבון מסוים. Gel filtration – שיטת כרומטוגרפיה להפרדה לפי גודל, לא מזהה חלבון מסוים. Coomassie staining – צביעה כללית של חלבונים בג’ל, לא ספציפית לחלבון מסוים.
by

מה ההבדל העיקרי בין השיטה לזיהוי GFP לבין זיהוי TNF-alpha במעבדות?

1
done
by
מיין לפי

מהן נקודות הדמיון העיקריות בין המעבדות?

1
done
by
מיין לפי