גנטיקה מולקולריתת

מהו אורך הקריאה (Read length) האופייני בשיטות ה-NGS לעומת שיטת סנגר?

1

שאלה #195980

		שתיהן מפיקות קריאות זהות באורך של 900 בסיסים.
		NGS מפיקה קריאות של מעל 10,000 בסיסים וסנגר כ-50 בסיסים.
		שיטת NGS מפיקה בדרך כלל קריאות קצרות (פחות מ-400 בסיסים), ואילו סנגר מפיקה קריאות ארוכות יותר (כ-900 בסיסים).
		קריאות NGS נמדדות בסנטימורגן ולא במספר בסיסים.

שיטת NGS מתאפיינת בקריאות קצרות יותר אך בכמות אדירה במקביל.

מיין לפי

מהם החסרונות המרכזיים של שיטת הריצוף סנגר (Sanger) כאשר מדובר בפרויקטים גדולים?

1

שאלה #195981

		היא פועלת רק על דנ"א מיטוכונדריאלי.
		היא יקרה מאוד ובעלת תפוקה נמוכה (Low throughput).
		היא מחייבת שימוש בחיידקים חיים בכל הרצה
		יש לה אחוז שגיאות של למעלה מ-50%.

שיטת סנגר איטית ויקרה מדי לריצוף של גנומים שלמים.

מיין לפי

איזו מטרה שאפתנית הוצבה בכנס מדעי בשנת 2004 לגבי ריצוף גנום?

1

שאלה #195982

		לרצף גנום שלם ב-1000 דולר בלבד תוך 10 שנים.
		לרצף את כל האוכלוסייה העולמית בחינם.
		להמיר את הגנום ל-RNA בתוך שעה.
		לרצף גנום מלא ללא שימוש במחשבים כלל.

היעד של "גנום ב-1000 דולר" הוביל לפיתוח מואץ של שיטות ה-NGS.

מיין לפי

איזה מאפיין מגדיר בצורה הטובה ביותר את טכנולוגיות ה-NGS (Next Generation Sequencing)?

1

שאלה #195983

		ריצוף המבוסס אך ורק על חלבוני בקרה.
		ריצוף ידני של מולקולה אחת בכל פעם
		קריאה של הגנום בעזרת מיקרוסקופ אור רגיל.
		ריצוף מאסיבי ומקבילי (Massively parallel sequencing) של מיליוני מקטעים יחד

היכולת לרצף כמות עצומה של מקטעים במקביל היא היתרון של NGS

מיין לפי

איזו מבין שיטות ה-NGS הבאות היא הנפוצה ביותר כיום בעולם?

1

שאלה #195984

		Illumina (Solexa).
		Sanger
		YAC
		RFLP

שיטת אילומינה שולטת כיום בשוק הריצוף העולמי.

מיין לפי

מהו השלב הראשון בהכנת תבנית הדנ"א לריצוף בשיטת Illumina?

1

שאלה #195985

		חימום הדנ"א ל-120 מעלות צלזיוס.
		חיתוך/שבירת הדנ"א למקטעים והוספת אדפטורים (Adaptors) בקצוות.
		המרת כל הדנ"א לחומצות אמינו.
		החדרת הדנ"א לתוך נגיפים.

הכנת הספריה מתחילה מחיתוך וחיבור מתאמים המאפשרים את המשך התהליך.

מיין לפי

מדוע מעדיפים להימנע מהגברת PCR סטנדרטית בשלבים הראשונים של שיטת Illumina?

1

שאלה #195986

		כי היא דורשת טמפרטורות קיפאון מתמדות.
		כי ה-PCR משמיד את האדפטורים.
		מכיוון שהיא לוקחת זמן, פחות מדויקת כמותית ומייצרת "רעש".
		משום שהיא פועלת רק על כרומוזומי המין.

הגברה מרובה ב-PCR במבחנה יוצרת שגיאות ורעשי רקע מיותרים.

מיין לפי

באיזו שיטה משתמשים ב-Illumina להגברת המקטעים על גבי הצ'יפ במקום PCR סטנדרטי?

1

שאלה #195987

		Clustering (יצירת צבירים מקומיים).
		שיבוט בתוך תאי שמרים.
		חיתוך על ידי אנזימי רסטריקציה חוזרים.
		אלקטרופורזה דו-ממדית.

שיטת הקלאסטרינג מגבירה את המקטע באופן מקומי על הסלייד ללא צורך במבחנה.

מיין לפי

כיצד נדבקים מקטעי הדנ"א לסלייד (Flow cell) בתחילת תהליך ה-Clustering?

1

שאלה #195988

		הם מודבקים פיזית בעזרת ג'ל אגרוז.
		האדפטורים נקשרים לאוליגו-נוקלאוטידים משלימים המקובעים לסלייד.
		בעזרת שדות מגנטיים רבי-עוצמה.
		הם אינם נדבקים אלא צפים בתמיסה.

האדפטורים בקצות המקטע מותאמים בדיוק לרצפים (אוליגוס) שעל הסלייד

מיין לפי

מה קורה בשלב ה-Clustering מיד לאחר שהגדיל המשלים הראשון סונתז על גבי הסלייד?

1

שאלה #195989

		מבצעים דנטורציה ומסלקים את הגדיל המקורי, כך שרק הגדיל המסונתז נשאר קשור לסלייד.
		הגדיל מתורגם מיידית לחלבון זוהר.
		הסלייד מוקפא כדי לשמר את שני הגדילים יחד לנצח.
		התא מתחלק לשני תאי בת עצמאיים.

שטיפת הגדיל המקורי משאירה רק את העותק המקובע פיזית לסלייד.

מיין לפי

Discuss, Learn and be Happy דיון בשאלות

מהו אורך הקריאה (Read length) האופייני בשיטות ה-NGS לעומת שיטת סנגר?

מהם החסרונות המרכזיים של שיטת הריצוף סנגר (Sanger) כאשר מדובר בפרויקטים גדולים?

איזו מטרה שאפתנית הוצבה בכנס מדעי בשנת 2004 לגבי ריצוף גנום?

איזה מאפיין מגדיר בצורה הטובה ביותר את טכנולוגיות ה-NGS (Next Generation Sequencing)?

איזו מבין שיטות ה-NGS הבאות היא הנפוצה ביותר כיום בעולם?

מהו השלב הראשון בהכנת תבנית הדנ"א לריצוף בשיטת Illumina?

מדוע מעדיפים להימנע מהגברת PCR סטנדרטית בשלבים הראשונים של שיטת Illumina?

באיזו שיטה משתמשים ב-Illumina להגברת המקטעים על גבי הצ'יפ במקום PCR סטנדרטי?

כיצד נדבקים מקטעי הדנ"א לסלייד (Flow cell) בתחילת תהליך ה-Clustering?

מה קורה בשלב ה-Clustering מיד לאחר שהגדיל המשלים הראשון סונתז על גבי הסלייד?

בקשה לשינוי התשובה / תיקון שאלה gavel

בקשה למחיקת השאלהmood_bad

בקשה לשינוי התשובה / תיקון שאלה

בקשה למחיקת השאלה